Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CITED4Q96RK1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms