Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CELF6Q96J87 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CELF6Q96J87 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms