Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCDC97Q96F63 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms