Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SIRT1Q96EB6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SIRT1Q96EB6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms