Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PRG4Q92954 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PRG4Q92954 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms