Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DNAAF3Q8N9W5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms