Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ANKRD53Q8N9V6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms