Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CRACR2BQ8N4Y2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CRACR2BQ8N4Y2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms