Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
HECW1Q76N89 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HECW1Q76N89 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms