Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LMOD2Q6P5Q4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LMOD2Q6P5Q4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms