Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ECM29Q5VYK3 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms