Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BROXQ5VW32 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BROXQ5VW32 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms