Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
SAPCD1Q5SSQ6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms