Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PIK3CD-AS1Q5SR53 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms