Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CEP78Q5JTW2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CEP78Q5JTW2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms