Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ESCO2Q56NI9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms