Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CTXN3Q4LDR2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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