Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRNQ16849 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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PTPRNQ16849 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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PTPRNQ16849 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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PTPRNQ16849 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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PTPRNQ16849 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTPRNQ16849 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
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