Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PCSK7Q16549 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PCSK7Q16549 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms