Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ZNF56Q15929 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ZNF56Q15929 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ZNF56Q15929 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ZNF56Q15929 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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ZNF56Q15929 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ZNF56Q15929 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ZNF56Q15929 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ZNF56Q15929 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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ZNF56Q15929 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
ZNF56Q15929 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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