Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PRKD1Q15139 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PRKD1Q15139 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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