Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CKAP5Q14008 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CKAP5Q14008 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
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