Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SNTB1Q13884 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms