Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NAE1Q13564 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NAE1Q13564 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NAE1Q13564 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NAE1Q13564 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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NAE1Q13564 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NAE1Q13564 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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