Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RPA4Q13156 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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