Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EXOSC9Q06265 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms