Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE3AQ05086 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3AQ05086 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms