Protein–RNA interactions for Protein: Q03519

TAP2, Antigen peptide transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP2Q03519 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TAP2Q03519 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms