Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PPARDQ03181 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms