Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TOP2BQ02880 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TOP2BQ02880 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms