Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HERVK_113P63132 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms