Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
RIPPLY3P57055 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
RIPPLY3P57055 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms