Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
DAP3P51398 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DAP3P51398 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DAP3P51398 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DAP3P51398 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DAP3P51398 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DAP3P51398 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
DAP3P51398 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DAP3P51398 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DAP3P51398 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DAP3P51398 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms