Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATRXP46100 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRXP46100 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRXP46100 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRXP46100 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRXP46100 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRXP46100 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRXP46100 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRXP46100 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATRXP46100 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATRXP46100 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATRXP46100 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms