Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
USP5P45974 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP5P45974 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP5P45974 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP5P45974 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP5P45974 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP5P45974 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP5P45974 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP5P45974 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP5P45974 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP5P45974 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP5P45974 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP5P45974 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP5P45974 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms