Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NR4A2P43354 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms