Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP6V1E1P36543 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP6V1E1P36543 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms