Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NTF4P34130 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NTF4P34130 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NTF4P34130 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF4P34130 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF4P34130 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF4P34130 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF4P34130 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF4P34130 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF4P34130 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF4P34130 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF4P34130 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF4P34130 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF4P34130 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NTF4P34130 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NTF4P34130 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms