Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCKARP32238 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCKARP32238 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms