Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLIP1P30622 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLIP1P30622 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms