Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXD10P28358 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXD10P28358 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms