Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTPREP23469 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PTPREP23469 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPREP23469 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTPREP23469 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPREP23469 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTPREP23469 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTPREP23469 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTPREP23469 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPREP23469 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPREP23469 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PTPREP23469 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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PTPREP23469 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PTPREP23469 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PTPREP23469 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PTPREP23469 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PTPREP23469 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PTPREP23469 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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