Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSR1P21757 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSR1P21757 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSR1P21757 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSR1P21757 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSR1P21757 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSR1P21757 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MSR1P21757 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSR1P21757 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSR1P21757 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSR1P21757 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSR1P21757 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MSR1P21757 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSR1P21757 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSR1P21757 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSR1P21757 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MSR1P21757 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MSR1P21757 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MSR1P21757 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MSR1P21757 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MSR1P21757 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MSR1P21757 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MSR1P21757 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MSR1P21757 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms