Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
LMNB1P20700 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LMNB1P20700 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms