Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB1P20618 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms