Protein–RNA interactions for Protein: P20472

PVALB, Parvalbumin alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PVALBP20472 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PVALBP20472 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PVALBP20472 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PVALBP20472 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms