Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF3P17036 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms