Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms