Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZNF35P13682 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZNF35P13682 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms