Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD8BP10966 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD8BP10966 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD8BP10966 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CD8BP10966 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CD8BP10966 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CD8BP10966 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CD8BP10966 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms